Il Regolamento (UE) 2016/2031 sulla salute delle piante fissa le regole per gli organismi nocivi da quarantena. Ai sensi dell'articolo 14, gli operatori professionali devono notificare immediatamente all'autorità competente il sospetto di un organismo nocivo da quarantena dell'Unione. Ai sensi dell'articolo 17, l'autorità deve adottare misure per eradicare un organismo nocivo confermato.
Un ritrovamento confermato porta di solito a una zona delimitata. L'articolo 18 la descrive come una zona infestata e una zona cuscinetto che la circonda. L'ampiezza della zona cuscinetto dipende dal modo in cui l'organismo nocivo si diffonde.
La Xylella fastidiosa è uno degli esempi più noti. La Commissione europea la descrive come uno dei batteri più pericolosi per le piante a livello mondiale. È stata trovata in più di 500 specie vegetali. Per l'eradicazione, la zona infetta copre almeno 50 metri attorno alle piante infette, con una zona cuscinetto di 2,5 chilometri.
Anche la Popillia japonica, lo scarabeo giapponese, è regolamentata da un apposito regolamento di esecuzione dell'UE. È stata segnalata per la prima volta nel nord Italia nel 2014 e si è diffusa in Svizzera. Può danneggiare più di 400 specie vegetali. Le sue larve possono viaggiare nel terriccio delle piante in vaso, e per questo i vivai sono una via di diffusione nota. I produttori nelle aree di focolaio devono rispettare condizioni rigide, come vendere piante a radice nuda o coltivare sotto protezione a prova di insetti durante il periodo di volo degli adulti.